最近のメタゲノム研究では、黒龍江省のげっ歯類がラッサウイルス、アムールウイルス、サルモネラ菌、ペスト菌など、驚くほど多様なウイルスや細菌を保有していることが明らかになった。
この研究では、マクロ＆マイクロテストの病原体RNA濃縮キットプローブ捕捉技術に基づく本手法は、宿主rRNAおよびその他の保存された宿主断片を選択的に除去することで、微生物RNAを効果的に保持し、病原体検出感度を大幅に向上させました。この病原体RNA濃縮ステップは、高い検出率を達成する上で極めて重要であり、病原体サーベイランスに強力な技術的支援を提供しました。
げっ歯類：人獣共通感染症の主要な媒介動物
げっ歯類は哺乳類の中で最も種の豊富さと分布範囲が広く、世界中に 2,000 種以上が存在し、哺乳類の全種の 40% 以上を占めています。
げっ歯類は生態学的重要性を超えて、多数の人獣共通感染症病原体の主要な保有者および媒介者としての役割を果たしています。げっ歯類の生息地は、直接の咬傷、排泄物との接触、ノミやダニを介した間接的な伝染などにより、人間の環境と頻繁に重なるため、げっ歯類が保有する病原体は公衆衛生上の永続的な脅威となります。
特に、新興感染症の 70% 以上は野生動物に由来しており、げっ歯類は最も重要なウイルス保有動物の 1 つです。
黒龍江省国境地域：病原体監視の最前線
中国北東部の国境省である黒龍江省は、豊富な生態資源を有し、複数の国と国境を接しています。豊かな生物多様性と頻繁な国境を越えた人口移動が相まって、病原体の伝播に好都合な条件を作り出しています。
2021年6月から7月にかけて、研究者らは牡丹江市横道河子鎮で野生げっ歯類67匹を採取した。採取されたサンプルは以下の通りである。
20ページアカネズミ半島
l 47ミオデス・ルフォカヌス
すべての標本は住宅地と周囲の農地で捕獲されたものであり、人間の居住地と野生生物の生息地の密接な境界面を浮き彫りにしている。
病原体濃縮技術：宿主背景干渉の克服
メタゲノムシーケンスでは、通常、宿主 RNA がシーケンスリードの大部分を占め、少量の病原体シグナルがマスクされます。
この課題に対処するために、この研究ではMacro & Micro-Test の病原体メタゲノム検出キット。 プローブキャプチャ技術を使用することで、特別に設計されたプローブが宿主の rRNA と保存された配列に結合し、それらの枯渇を可能にして微生物の RNA を濃縮します。
このアプローチにより病原体検出感度が大幅に向上し、下流のシーケンシングでより高い割合の病原体リードを回収できるようになりました。この濃縮ステップは、げっ歯類が保有する病原体スペクトルを正確に特徴付けるための強固な基盤を築きました。
濃縮後、RNAサンプルは逆転写、ライブラリ構築、ハイスループットシーケンシングを受けました。バイオインフォマティクス解析には以下のものが含まれます。
l 宿主ゲノムフィルタリング
Kraken2を用いた分類
l ワラビによる個体数補正
このワークフローにより、ウイルスおよび細菌のコミュニティの包括的なプロファイルが生成されました。
研究結果：複数のウイルスと細菌の共存
ウイルスの発見
検出されたウイルスは21のウイルスファミリーに属し、その中にはアレナウイルス科そしてハンタウイルス科.
を通して新規Megahit を使用したアセンブリにより、154 個のウイルス コンティグが生成され、そのうち 110 個が 8 つのファミリーの 19 個のウイルスと一致しました。
In アカネズミ半島以下のウイルスが特定されました。
l アレナウイルス：ラッサウイルス、温州ウイルス、ガイロウイルス
l ハンタウイルス：アムールウイルス、プウマラウイルス
In ミオデス・ルフォカヌスラットアルテリウイルスとアムールウイルスが検出されました。
これらの病原体には次のようなものがあります:
ラッサウイルスはウイルス性出血熱の原因物質であり、致死率は約 20% に達します。
アムールウイルスは、腎性出血熱症候群（HFRS）の原因となる病原体の一つです。中国はハンタウイルス感染症の世界的な負担が最も大きいと報告されています。
細菌検査結果
合計 1,051 個の細菌属が注釈付けされました。
最も豊富な属は以下のとおりです。
lサルモネラ（26～31％）
lエルシニア（11～23％）
サルモネラ腸チフスは主要な食中毒病原体であり、世界中で毎年推定 900 万件の腸チフス症例と約 11 万人の死亡を引き起こしています。
ペスト菌ペストの原因菌であるペストは、過去に3度のパンデミックを引き起こしてきました。黒龍江省は中国におけるペストの自然発生的な発生地の一つとして認識されており、ペスト監視の重点地域となっています。
研究の意義
科学的貢献
この研究は、黒龍江省のげっ歯類におけるラッサ熱ウイルス断片とネズミ動脈炎ウイルスの初めての報告であり、中国のげっ歯類媒介性病原体データベースを拡大するものである。
この研究は、地元のげっ歯類集団におけるウイルスおよび細菌のコミュニティを体系的に特徴付け、国境地域における人獣共通感染症の監視のための基礎データを提供します。
公衆衛生への影響
この調査結果は、継続的な監視と病原体スクリーニングの必要性を浮き彫りにしている。A.半島そしてM. rufocanus.
このデータは、ペストや腎症候群を伴う出血熱などの病気に対する発生源管理戦略を裏付ける科学的証拠を提供します。
方法論の強み
メタゲノム配列解析により、既知および新規の病原体の偏りのない検出が可能になります。
本研究では、マクロ＆マイクロテスト社の病原体濃縮技術が優れた性能を示し、複雑な生物学的サンプルにおける標的病原体の検出を効果的に向上させました。この結果は、野生生物監視における高感度病原体同定を支援する能力を裏付けています。
製品の推奨
この研究での成功した応用に基づき、マクロ＆マイクロテスト病原体 RNA 濃縮キットはメタゲノム監視研究に強く推奨されます。
このキットは、宿主の核酸を効率的に除去し、微生物配列を濃縮することで、検出感度とデータ品質を大幅に向上させます。複雑なサンプル中の病原体を正確に検出するための不可欠なツールであり、公衆衛生監視、人獣共通感染症リスク評価、アウトブレイク対策のための強力な技術サポートを提供します。
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投稿日時: 2026年3月2日