最近、中国疾病予防管理センター週刊誌2025年10月、四川省瀘州市の小学校で発生したC群ロタウイルス（RVC）による急性胃腸炎のアウトブレイクに関する疫学的・病因学的調査を記述した重要な研究論文が発表されました。特筆すべきは、マクロ＆マイクロテスト社のハイスループット標的病原体捕捉キット（プローブ捕捉）と全ゲノム濃縮シーケンス技術が、この調査において極めて重要な役割を果たしたことです。この技術は、正確な病原体同定と包括的なゲノム特性解析を可能にし、アウトブレイクの迅速な確認、正確な発生源追跡、そして効果的なアウトブレイク制御のための重要な科学的証拠を提供しました。
突発的な発生：中国南西部で初のRVC発生が報告される
2025年10月15日、瀘州市の小学校で急性胃腸炎の集団発生が発生した。同校の生徒と職員は合計1,943人で、32例が報告された。内訳は検査で確定された6例と臨床診断された26例で、全体の罹患率は1.65%であった。集団発生は10月15日から16日にかけてピークを迎え、7年生5組の罹患率が最も高かった（23.08%）。患者のほとんどは学齢期の児童（年齢中央値：10歳）で、主な症状は嘔吐（65.62%）、下痢（46.87%）、腹痛（37.50%）であった。症状は通常1～3日間続き、すべての患者は重篤な合併症なく回復した。
疫学調査により、最初の感染者は小学5年生、7組の11歳の男子生徒であることが判明した。彼の妹も彼より先に同様の症状を発症しており、家庭内感染が最初の感染源であったことが示唆された。嘔吐物の不適切な処理（消毒や区域隔離を伴わない直接的な掃き掃除と廃棄など）と生徒の不十分な手洗い習慣が、さらなる感染拡大を助長したと考えられる。感染した教室のほとんどは2階から5階に位置し、隣接する男子トイレを共有していたことから、エアロゾル感染と接触感染の両方が感染拡大に寄与した可能性がある。
ノロウイルスやA群ロタウイルスなどの通常の病原体スクリーニング検査で陰性結果が出たため、調査は特に困難を極めた。これは、珍しい病原体が原因であることを示唆していた。
病因診断：マクロ＆ミクロテストの全ゲノムシーケンス解析により原因を特定
ノロウイルスの初期検査は陰性でした。その後、瀘州市疾病予防管理センターは、8種類のウイルス、17種類の細菌、3種類の寄生虫を含む28種類の病原体を同時に検出できるマルチプレックス消化管病原体リアルタイムPCRアッセイを用いて、8つの臨床検体をスクリーニングしました。10月17日、6つの検体からC群ロタウイルスが陽性となり、原因病原体の特定に成功しました。
感染源をさらに追跡するため、調査員は5つの陽性サンプルに対し、ナノポアメタゲノムシーケンスとマクロ＆マイクロテスト社のプローブキャプチャー全ゲノム濃縮シーケンスの両方を実施した。この手法により、5つのRVCゲノム配列（SC01～SC05）の完全な配列を正常に取得できた。迅速なマルチプレックスPCRスクリーニングと高解像度全ゲノムシーケンスを組み合わせた統合戦略は、正確な分子疫学と感染源追跡のための強力な技術的支援を提供した。
科学的知見：中国南西部におけるM2遺伝子型の初の同定
マクロ＆マイクロテスト社の技術を用いて生成された高品質の全ゲノムデータに基づき、研究チームはいくつかの重要な科学的発見を報告した。
単クローン性感染症の発生確認：5つのウイルス分離株はすべて同一の全ゲノム遺伝子型（G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2）を共有しており、一塩基多型（SNP）の違いは0～1箇所のみであったことから、今回の感染拡大は単一の感染経路から発生したことが決定的に証明された。
M2遺伝子型の発見：系統解析の結果、瀘州市由来のRVC株は、これまで中国のRVC株で優勢と考えられていたM3遺伝子型ではなく、M2遺伝子型に属することが明らかになった。この発見は、中国におけるRVC遺伝子型の分布に関する従来の理解に疑問を投げかけ、中国南西部におけるM2遺伝子型の出現を裏付けるものである。
国際的な感染経路を示す証拠：全ゲノム比較により、瀘州株と、雲南省（2025年）、ロシアのノボシビルスク（2017年）、イタリア（2012年）で以前に報告されたRVC株との間に高い遺伝的類似性が示され、活発なユーラシア伝播ネットワークの存在が示唆された。
予防と管理への示唆：早期発見と迅速な介入が不可欠
病原体の特定後、瀘州市疾病予防管理センターは直ちに、症例隔離、環境消毒、嘔吐物の標準化された処理、授業の一時停止など、包括的な対策を実施した。その結果、感染拡大は潜伏期間内に収束し、10月21日以降、新たな症例は報告されていない。
今回の調査は、公衆衛生上の重要な教訓も示している。A群ロタウイルスとノロウイルスの両方の検査で陰性となった集団発生性の胃腸炎の場合、C群ロタウイルスやその他のA群以外のロタウイルスを日常的な診断スクリーニングに組み込むべきである。
本研究は、中国南西部で報告された初のC群ロタウイルスのアウトブレイクであり、同地域で初めてM2遺伝子型が同定されたことを示すもので、東アジアにおけるロタウイルス感染症の疫学に関する現在の理解を深めるものです。今回の調査では、マクロ＆マイクロテスト社のマルチプレックスPCRスクリーニングと全ゲノム濃縮シーケンスを組み合わせた統合ソリューションが、迅速な病原体同定と高解像度の分子起源追跡の両方を可能にすることで、実用上非常に高い価値を示しました。これにより、将来の感染症アウトブレイクの正確な調査と制御のための再現性のある技術的枠組みが提供されます。
投稿日時：2026年7月30日