最近のメタゲノム研究により、黒竜江省のげっ歯類が保有するウイルスや細菌の種類が非常に多様であることが明らかになった。これには、ラッサウイルス、アムールウイルス、サルモネラ菌、ペスト菌などが含まれる。
この研究では、Macro & Micro-Test社製 病原体RNA濃縮キットプローブ捕捉技術に基づいたこの方法は、宿主rRNAやその他の保存された宿主断片を選択的に除去することで、微生物RNAを効果的に保持し、病原体検出感度を大幅に向上させた。この病原体RNA濃縮ステップは、高い検出率を達成する上で極めて重要であり、病原体監視のための強力な技術的支援を提供した。
げっ歯類：人獣共通感染症の主要な宿主
齧歯類は哺乳類の中で最も種数が多く、分布範囲も広いグループであり、世界中に2,000種以上が生息し、全哺乳類種の40%以上を占めている。
げっ歯類は生態学的に重要なだけでなく、数多くの人獣共通感染症病原体の主要な宿主および媒介動物としての役割も果たしている。げっ歯類の生息地は、直接の咬傷、排泄物との接触、あるいはノミやダニを介した間接的な感染などを通じて、人間の生活環境と頻繁に重なるため、げっ歯類が保有する病原体は、公衆衛生上の継続的な脅威となる。
特筆すべきは、新興感染症の70%以上が野生動物に由来し、中でもげっ歯類は最も重要なウイルス宿主の一つとなっている点である。
黒竜江省国境地域：病原体監視の最前線
中国東北部の国境地帯に位置する黒竜江省は、豊富な生態系資源を有し、複数の国と国境を接している。豊かな生物多様性と頻繁な国境を越えた人口移動が相まって、病原体の伝播に好都合な環境を作り出している。
2021年6月から7月にかけて、研究者らは牡丹江市横道河子鎮で野生齧歯類67匹を採集した。サンプルは以下の通り。
l 20アカネズミ半島
l 47ミオデス・ルフォカヌス
全ての標本は住宅地とその周辺の農地で捕獲されており、人間の居住地と野生生物の生息地との密接な接点を浮き彫りにしている。
病原体濃縮技術：宿主背景干渉の克服
メタゲノムシーケンスでは、通常、宿主RNAがシーケンスリードの大部分を占めるため、低存在量の病原体シグナルが覆い隠されてしまう。
この課題に対処するため、本研究では以下の方法を採用した。マクロ＆ミクロテスト社の病原体メタゲノム検出キット。 プローブ捕捉技術を用いることで、特別に設計されたプローブが宿主のrRNAおよび保存配列に結合し、それらを除去することで微生物RNAを濃縮することが可能となる。
この手法により病原体検出感度が大幅に向上し、下流のシーケンス解析でより多くの病原体リードを回収できるようになった。濃縮ステップは、げっ歯類が保有する病原体スペクトルを正確に特徴づけるための強固な基盤を築いた。
濃縮後、RNAサンプルは逆転写、ライブラリー構築、およびハイスループットシーケンスに供された。バイオインフォマティクス解析には以下が含まれる。
宿主ゲノムフィルタリング
l Kraken2を用いた分類学的分類
l ワラビを用いた存在量補正
このワークフローにより、ウイルスおよび細菌群集の包括的なプロファイルが生成された。
研究結果：複数のウイルスと細菌の同時流行
ウイルスの発見
検出されたウイルスは、以下の21のウイルス科に属していた。アレナウイルス科そしてハンタウイルス科.
を通してデノボMegahitを用いたアセンブリにより154個のウイルスコンティグが生成され、そのうち110個が8つの科に属する19個のウイルスと一致した。
In アカネズミ半島以下のようなウイルスが同定された。
l アレナウイルス：ラッサウイルス、温州ウイルス、ガイロウイルス
l ハンタウイルス：アムールウイルス、プウマラウイルス
In ミオデス・ルフォカヌスラットアルテリウイルスとアムールウイルスが検出された。
これらの病原体の中には、
ラッサウイルスはウイルス性出血熱の原因ウイルスであり、致死率は約20％に達する。
ハンタウイルス・アムールウイルスは、腎症候性出血熱（HFRS）の原因となる病原体の1つである。ハンタウイルス感染症の罹患率は、世界で最も高いのは中国である。
細菌学的所見
合計1,051の細菌属が注釈付けされた。
最も多く見られた属は以下のとおりです。
lサルモネラ（26～31％）
lエルシニア（11～23％）
サルモネラは主要な食中毒病原体であり、世界中で年間推定900万件の腸チフス症例と約11万人の死亡の原因となっている。
ペスト菌ペストの原因菌であるウイルスは、過去に3度のパンデミックを引き起こしました。黒竜江省は中国におけるペストの自然発生地の一つとして認識されており、ペスト監視の優先地域となっています。
本研究の意義
科学的貢献
本研究は、黒竜江省の齧歯類からラッサウイルス断片とラット動脈炎ウイルスが検出されたことを初めて報告するものであり、中国の齧歯類媒介性病原体のデータベースを拡充するものである。
この研究は、地域の齧歯類集団におけるウイルスおよび細菌群集を体系的に特徴づけ、国境地域における人獣共通感染症の監視のための基礎データを提供する。
公衆衛生上の影響
この調査結果は、継続的な監視と病原体スクリーニングの必要性を強調している。A. 半島そしてM. rufocanus.
このデータは、ペストや腎症候性出血熱などの疾病に対する感染源制御戦略を裏付ける科学的証拠を提供するものである。
方法論上の強み
メタゲノムシーケンス解析により、既知の病原体と新規の病原体の両方を偏りなく検出することが可能になる。
本研究において、マクロ＆マイクロテスト社の病原体濃縮技術は優れた性能を発揮し、複雑な生物学的サンプル中の標的病原体の検出を効果的に向上させた。この結果は、野生生物監視における高感度な病原体同定を支援する同社の能力を裏付けるものである。
製品のおすすめ
本研究におけるその成功に基づき、マクロ＆ミクロテスト病原体RNA濃縮キットは、メタゲノムサーベイランス研究に強く推奨される。
宿主核酸を効率的に除去し、微生物配列を濃縮することで、本キットは検出感度とデータ品質を大幅に向上させます。複雑なサンプル中の病原体を正確に検出するための不可欠なツールであり、公衆衛生監視、人獣共通感染症リスク評価、およびアウトブレイク対策のための強力な技術サポートを提供します。
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投稿日時：2026年3月2日